مطالعه تنوع و روابط ژنتیکی بین برخی از ژنوتیپ‎های پنبه دیپلوئید و تتراپلوئید ایران با استفاده از مارکر RAPD

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 استادیار مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی خراسان رضوی

2 استاد پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی، کرج

3 دانشیار دانشگاه آزاد اسلامی وحد علوم و تحقیقات تهران

4 استاد گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه تبریز

چکیده

گونه‎های جنس Gossypium (حدودا 42 گونه) ذخایر عظیمی از تنوع ژنتیکی برای اصلاح پنبه زراعی هستند. برای تعیین روابط ژنتیکی درون و بین گونه‎ای جنس ,Gossypium  30 جفت آغازگر(Primer) ده تایی RAPD روی 13 رقم از دو گونه دیپلوئید زراعی( Gossypium herbaceum L. (A1)  و Gossypium arboreum L. (A2) و 11 ژنوتیپ از دو گونه تتراپلوئید  Gossypium hirsutum L. (AD) استفاده گردید. با استفاده از مارکر RAPD  کلاً 422 باند تکثیر که  366 (87/7٪) تا از این باندها چند شکلی بودند. تشابهات ژنتیکی بین تمام گونه‎ها محاسبه گردید و بر اساس آنها دندروگرام مربوطه به روشUPGMA ترسیم گردید که با روابط تاکسونومی بین گونه‎ها یکی بود. در برخی موارد روابط خویشاوندی به خوبی با گروه‎بندی ژنتیکی استنتاج و تایید شد. تجریه خوشه‎ای بر اساس تشابهات ژنتیکی برای شناسایی ژنتیکی ارقامی که به طور بالقوه ذخایر مهمی از ژرم‎پلاسم برای اصلاح پنبه خصوصاً صفات کیفی الیاف هستند، صورت گرفت.

کلیدواژه‌ها

عنوان مقاله [English]

Study of genetic diversity and relationships among some diploid and tetraploid cotton genotypes of Iran using RAPD's Marker

نویسندگان [English]

  • M.R. Ramazani-moghaddam 1
  • E. Majidi-haravan 2
  • H.R. Zamani-zadeh 3
  • S.A. Mohammadi 4
  • M. Azizi 1
1 Assistant Prof. Agricultural and Natural Resources, Research Center of Khorasan Razavi, Iran
2 Prof. Agriculture Biotechnology Research Institute, Karaj, Iran
3 Associate Prof. Azad University, Science and Research unit, Tehran. Iran
4 Prof. Tabriz University, Agronomy and Plant Breeding Department, Iran
چکیده [English]

Gossypium species (about 49 species) are vast resources of genetic diversity for improvement of cultivated cotton. To determine  intra- and  inter-specific genetic diversity and  relationships, it was  employed 30 RAPD's random decamer primers on twenty eight cotton accessions from 2 diploid cultivated species (G.arboreum, G.herbaceum) and 2 tetraploid cultivated species (G.hirsutum, G.barbadense). A total of 422 RAPD bands were amplified of which 88% (366) were polymorphic. Similarity indices estimated on the basis RAPD markers and cluster analysis based on similarity values showed high correspondence between RAPD marker system and known taxonomic relationships.

کلیدواژه‌ها [English]

  • DNA fingerprinting
  • Gossypium Species
  • genetic similarity
  • Family Relationships

مراجع

Abdalla, A.M., Reddy, O., El-Zik, K.M., and Pepper, A.E. 2001. Genetic diversity and relationships of diploid and tetraploid cottons revealed using AFLP. Theor. Appl. Genet. 102: 222-229.
Alishah, O. 2001. Study of morphological traits and genetic variation in different genotypes of upland cotton (Gossypium hirsutum) in Iran. Journal of seed and plant. 17(1): 44-60.
Ghasemi Bezdi K., Abdemishani, S., Hosseinzadeh, H., and Seyedtabatabei, B.A., 2000. Study on DNA polymorphism among some genotypes of Upland cotton (Gossypium hirsutum) using RAPD-PCR technique. Journal of Agricul. Sci. of Iran. 31: 689-700.
Iqbal M.J., and Rayburn, A.L. 1994. Stability of RAPD markers for determining cultivar specific DNA profiles in rye (Secale cereal L.) Euphytica, 75: 215-220.
Iqbal, M.J., Aziz, N., Saeed, N.A., Zafar, Y. and Malik, K.A. 1997. Genetic diversity evaluation of some elite cotton varieties by RAPD analysis. Theor. Appl. Genet. 94:139-144.
Li, H., Luo, J., Hemphill, J.K., Wang, J.T. and Gould, J.H. 2001. A rapid and high yielding DNA miniprep for cotton (Gossypium spp.). Plant Mol. Biol. Report. 19:183a-183e.
Ramazani Moghaddam, M.R., Majidi-haravan, E., Zamani-zadeh, H.R., Mohammadi, S.A. and Azizi, M. 2006. Study on genetic diversity in diploid cotton (Gossypium herbaceum, G. arboreum) using morphological traits. Journal of Agricultural Science. 4: 721-831.
Ramazani Moghaddam, M.R., and Talat, F. 2006. Investigation of general and specific combining ability in cotton using line × tester analysis. Journal of Agricultural Science. Special Issue (No.1). P: 57-65.
Ramazani-Moghaddam, M.R., Majidi, I., Zamanizadeh, H.R., Mohammadi, S.A., and Azizi, M. 2004. Genetic variation for improving the salt tolerance of domesticated diplod cotton. Book of Absratcts. ICGI-2004 Conference. pp: 92. Heyderabad, India.
Ramazani Moghaddam, M.R., 2004. Determination of the best selection index for cotton species (Gossypium sp.) under salinity stress and non-stress conditions. Ph.D. thesis of Azad University, Science and Research unit, Tehran. Iran. 187pp.
Stanton, M.A., Stewart, J., and Percival, A.E. 1994. Morphological diversity in the A genome cotton G. arboreum and G. herbaceum. Crop Sci. 34: 519-526.
Tatineni, V., Cantrell, R.G. and Davis, D.D. 1996. Genetic diversity in elite cotton germplasm determined by morphological characteristics and RAPDs. Crop Sci., 36:186-192.
Vafaie-Tabar, M. 2003. Studies on interspecific hybridization in Gossypium spp., Ph.D. Thesis. Faculty of the Post-Graduate School, Indian Agricultural Research Institute, New Delhi.
Williams, W.A., Jones, M.B. and Demment, M.W. 1990. A concise table for path analysis statistic. Agron. J. 82:1022-1024.
Zhang J. and McD. Stewart, J. 2000. Economical and rapid method for extracting cotton genomic DNA. J. of Cotton Sci. 4:193-201.
 

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار