ردیابی آلودگی های فوزاریومی بذور پنبه با استفاده از صفات ریخت شناسی و نشانگر مولکولی

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانشجوی کارشناسی‌ارشد بیماری‌شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه علم و فرهنگ شعبه کاشمر

2 استادیار مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی خراسان رضوی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، مشهد، ایران

3 مربی دانشکده کشاورزی، دانشگاه علم و فرهنگ شعبه کاشمر

چکیده

به منظور بررسی وضعیت آلودگی بذور پنبه به قارچ فوزاریوم، نمونه هایی ازطبقات مختلف 10 رقم پنبه از استانهای خراسان جنوبی، رضوی، گلستان و فارس تهیه شد. قسمتهای مختلف بذر که شامل بذرکامل، پوسته، مغز (آندوسپرم + جنین)، آندوسپرم و جنین بود، در محیطهای غذایی سیب زمینی دکستروزآگار وآب آگار کشت گردید. از تعداد 23 نمونه بذر پنبه، 76 جدایه فوزاریوم بدست آمد. آلودگی بذور کرکدار و دلینته به قارچ فوزاریوم به ترتیب 7/98 و 3/1 درصد بود. از بین بذور مورد بررسی در این تحقیق، رقم ورامین با 35 جدایه دارای بیشترین درصد آلودگی بود. بیشترین درصد جداسازی قارچ فوزاریوم مربوط به مغز بود. شنـاسایی بر اسـاس صفات ریخت شناسی نشان داد جدایـه‌های مذکـور به تـرتیب با فـراوانی 39، 23، 10، 2، 1 و 1 جـدایه متعلق به گونه های Fusarium equiseti، F. proliferatum، F. semitectum، F. compactum، F. nygamai و F. solani مـیبـاشنـد. گـونـه‌هـای F. compactum وF. nygamai برای اولین بار در ایران از بذور پنبه گزارش میشوند. بکارگیری واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز و استفاده از آغـازگرهای اختصاصی گونـه های غالب F. equiseti و F. proliferatum، با استفاده از DNA گونه قارچی مربوطه و همچنین DNA بذوری که به طور طبیعی به این گونه-ها آلوده بودند، منجر به تولید نوارهای DNA اختصاصی شد. به این ترتیب نتایج شناسایی این دو گونه بر اساس صفات ریخت شناسی، با روش مولکولی نیز مورد تأیید قرار گرفت. این مطالعه نشان داد، ردیابی فوزاریومهای مذکور در بذور آلوده با استفاده از واکنش PCR امکان پذیر است.

کلیدواژه‌ها


عنوان مقاله [English]

Detection of Fusarium contamination of cotton seeds using morphological traits and molecular markers

نویسندگان [English]

  • ali akbarzadeh 1
  • Mojtaba Morad-zadeh Eskandari 2
  • Mohammad Reza Ramazani Moghaddam 2
  • Fatemeh Azad Disfani 2
  • ahmad drakhshan 3
1 M.Sc student in plant diseases, College of Agriculture, Science and Culture University of Kashmar, Iran
2 Assistant Prof., Agriculture and Natural Resources Research and Education Center of Khorasan- Razavi, Agricultural Research, Education and Extension Organization, Mashhad, Iran
3 Instructor in College of Agriculture, Science and Culture University of Kashmar, Iran
چکیده [English]

In order to investigate the contamination of cotton seeds with Fusarium fungi, samples of different classes of 10 cotton cultivars were obtained from Southern Khorasan, Razavi, Golestan and Fars provinces. Various sections of a seed such as full seed, coat, kernel (endosperm and embryo), endosperm and embryo were cultured on the nutrient medium of potato dextrose agar and water agar. Of the 23 cotton seed samples, 76 isolates of Fusarium was obtained. The contamination in fuzzy and delinted seeds were 98.7 and 1.3 percent respectively. The hightest percentage of purified Fusarium was from kernel. Identification based on morphological traits showed that the isolates with the frequency of 39, 23, 10, 2, 1 and 1 isolates belonging to the species Fusarium equiseti, F. proliferatum, F. semitectum, F. compactum, F. nygamai and F. solani. Species of F. compactum and F. nygamai are reported for the first time from Iran. The application of Polymerase chain reaction and the use of specific primers of F. equiseti and F. proliferatum dominant species have led to the production of proprietary DNA bands using the DNA of the relevant fungal species, as well as the seed DNA that naturally contaminated these species. In this way, the results of identification of these two species based on morphological traits were confirmed by the molecular method. This study revealed that Fusarium traces are detected in infected seeds using the PCR reaction.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Endosperm
  • Morphological
  • Molecolar
  • fuzzy
  • Varamin